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Fields »
 

Field

Term
Gene name

Class

Subclass

Chromosome

External id

In atlas

Reliability

Reliability

Reliability

Validation

Method

Validation

Method

Validation

Method

Validation

Location

Searches

Tissue

Cell type

Expression

Tissue

Specificity

Cell line

Specificity

Tissue

Detectable

Cell line

Detectable

Category

Score

Score

Score

Antibodies

Column

 
 
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TISSUE ATLAS PRIMARY DATA ADIPOSE TISSUE

GENE/PROTEIN

Antibody validation


Dictionary

Soft tissue

Tissue proteome

Adipose

SOFT TISSUE - Expression summary

RNA expression

HPA:0.0TPM
GTEx:1.1RPKM
FANTOM5:0.0Tags Per Million

SOFT TISSUE 1 - Annotated protein expression

 

Antibody staining

Antibody HPA037753

 

Adipocytes

Not detected  

Fibroblasts

Not detected  

Peripheral nerve

Not detected  
 
 
 

SOFT TISSUE 2 - Annotated protein expression

 

Antibody staining

Antibody HPA037753

 

Adipocytes

Low  

Chondrocytes

Not detected  

Fibroblasts

Not detected  
 
 
 

ADIPOSE TISSUE - HPA RNA-seq

Average TPM

0.0

N/A Female, age 80
Sample 1
TPM: 0.0
Cell types%
Adipocytes: 95
Other cell types: 5
N/A Female, age 45
Sample 2
TPM: 0.0
N/A Female, age 57
Sample 3
TPM: 0.0
Cell types%
Adipocytes: 60
Fibroblasts: 20
Smooth muscle cells: 15
Other cell types: 5
overview Female, age 74
Sample 4
TPM: 0.1
Cell types%
Adipocytes: 50
Fibroblasts: 30
Smooth muscle cells: 15
Other cell types: 5
overview Female, age 59
Sample 5
TPM: 0.2
Cell types%
Adipocytes: 40
Fibroblasts: 40
Smooth muscle cells: 15
Other cell types: 5

ADIPOSE TISSUE - GTEx RNA-seq

Average RPKM

1.1

GTEx sample id

RPKM

 

Adipose - Subcutaneous

Adipose - Subcutaneous
RPKM: 0.0
Samples: 350

Max RPKM: 1.6
Min RPKM: 0
Std RPKM: 0.1
Median RPKM: 0
GTEX-OXRL-0226-SM-3NB18 1.6
GTEX-SNOS-1426-SM-32PLY 1.3
GTEX-11XUK-2126-SM-5EQLR 0.8
GTEX-111VG-2326-SM-5N9BK 0.5
GTEX-13NYS-0226-SM-5MR49 0.5
GTEX-WH7G-2226-SM-3NMBN 0.4
GTEX-Z9EW-1826-SM-5CVMA 0.4
GTEX-13PVR-2426-SM-5RQHN 0.3
GTEX-OHPM-0226-SM-3LK61 0.3
GTEX-XMD2-0226-SM-4WWEE 0.3
GTEX-11EQ8-0226-SM-5EQ5G 0.2
GTEX-11GSO-2326-SM-5A5LX 0.2
GTEX-11UD2-0126-SM-5EQL2 0.2
GTEX-132AR-0226-SM-5IJBE 0.2
GTEX-1399R-2626-SM-5KLZ7 0.2
GTEX-139TU-0226-SM-5J1NM 0.2
GTEX-13N11-2626-SM-5K7UQ 0.2
GTEX-14753-0326-SM-5QGQB 0.2
GTEX-P4QT-0226-SM-3LK68 0.2
GTEX-S4Q7-1626-SM-3K2AE 0.2
GTEX-XMK1-2226-SM-4B673 0.2
GTEX-XPVG-2726-SM-4B66W 0.2
GTEX-XV7Q-2626-SM-4BRVA 0.2
GTEX-ZTSS-2026-SM-5987K 0.2
GTEX-11TUW-2626-SM-5EQKZ 0.1
GTEX-11UD1-0226-SM-5EQKL 0.1
GTEX-11ZTS-0226-SM-5EQKD 0.1
GTEX-1212Z-2426-SM-5EQ5D 0.1
GTEX-12ZZX-0226-SM-5DUXU 0.1
GTEX-13FHO-0326-SM-5IJBH 0.1
GTEX-13FTY-0626-SM-5L3F8 0.1
GTEX-13JVG-0226-SM-5J1MW 0.1
GTEX-13NZA-0126-SM-5K7UH 0.1
GTEX-13PDP-0226-SM-5K7W9 0.1
GTEX-13SLW-0226-SM-5S2NA 0.1
GTEX-13YAN-0426-SM-5O9DR 0.1
GTEX-146FR-1826-SM-5QGPF 0.1
GTEX-14BIL-0226-SM-5SI9E 0.1
GTEX-RU72-1026-SM-46MUG 0.1
GTEX-SN8G-0226-SM-4DM6B 0.1
GTEX-T2IS-0226-SM-32QPH 0.1
GTEX-X4EO-0426-SM-4QASA 0.1
GTEX-X8HC-0226-SM-4E3K1 0.1
GTEX-Y5V5-2426-SM-5IFJA 0.1
GTEX-ZVP2-1826-SM-5GU62 0.1
GTEX-ZVT4-0226-SM-51MSD 0.1
GTEX-111CU-1826-SM-5GZYN 0.0
GTEX-111FC-0226-SM-5N9B8 0.0
GTEX-111YS-2426-SM-5GZZQ 0.0
GTEX-1122O-2026-SM-5NQ91 0.0
GTEX-1128S-2126-SM-5H12U 0.0
GTEX-113IC-0226-SM-5HL5C 0.0
GTEX-117YX-2226-SM-5EGJJ 0.0
GTEX-11DXW-0326-SM-5H11W 0.0
GTEX-11DXX-2326-SM-5Q5A2 0.0
GTEX-11DZ1-0226-SM-5A5KF 0.0
GTEX-11EI6-0226-SM-5EQ64 0.0
GTEX-11EM3-2326-SM-5H12B 0.0
GTEX-11EMC-2826-SM-5PNY6 0.0
GTEX-11EQ9-2526-SM-5HL66 0.0
GTEX-11GS4-2626-SM-5A5LD 0.0
GTEX-11H98-0226-SM-5NQ89 0.0
GTEX-11I78-2626-SM-5Q5AI 0.0
GTEX-11LCK-1126-SM-5A5KC 0.0
GTEX-11O72-0226-SM-59869 0.0
GTEX-11OF3-2426-SM-5Q5AS 0.0
GTEX-11ONC-2526-SM-5986W 0.0
GTEX-11P7K-2026-SM-5GU74 0.0
GTEX-11P81-2426-SM-5GU65 0.0
GTEX-11P82-1726-SM-5Q5AT 0.0
GTEX-11PRG-0626-SM-5BC56 0.0
GTEX-11TTK-0226-SM-5N9EC 0.0
GTEX-11WQC-2426-SM-5EQKQ 0.0
GTEX-11ZTT-2526-SM-5EQM9 0.0
GTEX-11ZU8-2426-SM-5EQMV 0.0
GTEX-11ZUS-0726-SM-59886 0.0
GTEX-11ZVC-2626-SM-5FQTA 0.0
GTEX-1211K-2226-SM-5FQU6 0.0
GTEX-12126-0426-SM-5Q5AP 0.0
GTEX-12584-0226-SM-5EQL5 0.0
GTEX-12696-2526-SM-5EQLN 0.0
GTEX-1269C-2726-SM-5EGJ4 0.0
GTEX-12C56-1626-SM-5FQUO 0.0
GTEX-12KS4-0426-SM-5EQMC 0.0
GTEX-12WSA-0326-SM-5BC6I 0.0
GTEX-12WSB-0226-SM-5GCOR 0.0
GTEX-12WSC-0226-SM-5EQ52 0.0
GTEX-12WSD-0226-SM-59HKO 0.0
GTEX-12WSM-0226-SM-5LZV6 0.0
GTEX-12ZZY-0326-SM-5LZVQ 0.0
GTEX-12ZZZ-0526-SM-5DUX6 0.0
GTEX-13111-1726-SM-5EGJZ 0.0
GTEX-13112-2726-SM-5DUW5 0.0
GTEX-13113-1826-SM-5LZW4 0.0
GTEX-1313W-0226-SM-5LZV7 0.0
GTEX-1314G-1626-SM-5EQ67 0.0
GTEX-131XE-2426-SM-5EQ5V 0.0
GTEX-131XF-2226-SM-5EQKG 0.0
GTEX-131XW-0526-SM-5PNXZ 0.0
GTEX-131YS-0226-SM-5IJEH 0.0
GTEX-133LE-1926-SM-5N9FV 0.0
GTEX-1399T-2726-SM-5K7XK 0.0
GTEX-1399U-2426-SM-5K7XB 0.0
GTEX-139D8-0326-SM-5IJCJ 0.0
GTEX-139T4-0126-SM-5HL5G 0.0
GTEX-139T6-2126-SM-5KM37 0.0
GTEX-139T8-0226-SM-5L3EA 0.0
GTEX-139YR-2426-SM-5J1OB 0.0
GTEX-13CF2-2626-SM-5LZZA 0.0
GTEX-13CF3-2326-SM-5IFGL 0.0
GTEX-13D11-2326-SM-5IJCY 0.0
GTEX-13FH7-2226-SM-5IJD4 0.0
GTEX-13FHP-0226-SM-5K7WD 0.0
GTEX-13FTW-2526-SM-5IJC8 0.0
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GTEX-13IVO-0226-SM-5LZXU 0.0
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GTEX-13NZ8-0926-SM-5MR3U 0.0
GTEX-13NZ9-0526-SM-5J1OX 0.0
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GTEX-13O3P-0226-SM-5KM3Z 0.0
GTEX-13O3Q-2326-SM-5KM3G 0.0
GTEX-13O61-2426-SM-5J1NV 0.0
GTEX-13OVI-1326-SM-5IJBO 0.0
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GTEX-13OW8-1226-SM-5K7XD 0.0
GTEX-13PLJ-0126-SM-5L3HU 0.0
GTEX-13PVQ-0226-SM-5SIBG 0.0
GTEX-13QBU-2526-SM-5LU4X 0.0
GTEX-13QJ3-0426-SM-5RQHP 0.0
GTEX-13RTJ-2526-SM-5S2Q3 0.0
GTEX-13S7M-0226-SM-5S2UG 0.0
GTEX-13SLX-0426-SM-5QGRC 0.0
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GTEX-13VXT-0226-SM-5LU9Q 0.0
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GTEX-13W3W-2526-SM-5SI9P 0.0
GTEX-13X6K-0226-SM-5QGPB 0.0
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GTEX-144GM-1926-SM-5LUAN 0.0
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GTEX-N7MS-0326-SM-4E3K2 0.0
GTEX-NFK9-0326-SM-3MJGV 0.0
GTEX-NL3G-0226-SM-4RGLU 0.0
GTEX-NPJ8-0226-SM-48TBN 0.0
GTEX-O5YT-0226-SM-32PK5 0.0
GTEX-O5YV-0226-SM-48TBY 0.0
GTEX-OHPK-0226-SM-3MJH6 0.0
GTEX-OHPN-0226-SM-48TBV 0.0
GTEX-OIZH-0226-SM-2YUMH 0.0
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GTEX-OOBJ-0226-SM-2YUMM 0.0
GTEX-OOBK-0226-SM-2YUMF 0.0
GTEX-OXRK-0326-SM-3NB3R 0.0
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GTEX-OXRO-0226-SM-3LK6F 0.0
GTEX-OXRP-0226-SM-3NB14 0.0
GTEX-P44H-0326-SM-2XCES 0.0
GTEX-P4PP-0226-SM-5S2VR 0.0
GTEX-P4PQ-0226-SM-2S1NK 0.0
GTEX-P4QR-0426-SM-2S1NV 0.0
GTEX-P4QS-0226-SM-3NB1U 0.0
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GTEX-PLZ4-0226-SM-5SI7M 0.0
GTEX-PLZ5-1826-SM-3NB22 0.0
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GTEX-POMQ-2326-SM-5S2VS 0.0
GTEX-POYW-0726-SM-2XCEO 0.0
GTEX-PSDG-0326-SM-48TCP 0.0
GTEX-PWCY-1926-SM-3NB25 0.0
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GTEX-PWOO-2226-SM-2S1P1 0.0
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GTEX-Q2AH-1726-SM-3NB2B 0.0
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GTEX-Q734-1826-SM-2I3EL 0.0
GTEX-QCQG-1826-SM-2S1P2 0.0
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GTEX-QDVJ-1826-SM-2S1P3 0.0
GTEX-QEG4-0326-SM-5S2UQ 0.0
GTEX-QEG5-0326-SM-2S1PB 0.0
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GTEX-XLM4-0226-SM-4AT4N 0.0
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GTEX-XQ3S-1626-SM-4WAYN 0.0
GTEX-XQ8I-0526-SM-4BOPS 0.0
GTEX-XUJ4-2526-SM-4BOO4 0.0
GTEX-XUW1-0526-SM-4BOP3 0.0
GTEX-XUYS-0226-SM-47JX1 0.0
GTEX-XUZC-1826-SM-4BRVO 0.0
GTEX-XXEK-2426-SM-4BRUS 0.0
GTEX-XYKS-2726-SM-4E3IC 0.0
GTEX-Y111-0226-SM-4SOIW 0.0
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Adipose - Visceral (Omentum)

Adipose - Visceral (Omentum)
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Samples: 227

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ADIPOSE TISSUE - FANTOM5 CAGE

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