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Fields »
 

Field

Term
Gene name

Class

Subclass

Chromosome

External id

In atlas

Reliability

Reliability

Reliability

Validation

Method

Validation

Method

Validation

Method

Validation

Location

Searches

Tissue

Cell type

Expression

Tissue

Specificity

Cell line

Specificity

Tissue

Detectable

Cell line

Detectable

Category

Score

Score

Score

Antibodies

Column

 
 
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TISSUE ATLAS PRIMARY DATA SKIN

GENE/PROTEIN

Antibody validation


Dictionary

Skin
Anal skin

Tissue proteome

Extended skin samples
Skin

SKIN - Expression summary

Protein expression

h
m
l
n

RNA expression

HPA:0.0TPM
GTEx:40.5RPKM

SKIN 1 - Annotated protein expression

Annotated protein
expression

Fibroblasts:Not detected
Keratinocytes:Not detected
Langerhans:Not detected
Melanocytes:Not detected
 

Antibody staining

Antibody HPA053977

 

Antibody HPA058943

 

Fibroblasts

Not detected   Not detected  

Keratinocytes

Not detected   Not detected  

Langerhans

Not detected   Not detected  

Melanocytes

Not detected   Not detected  
   
   
   

SKIN 2 - Annotated protein expression

Annotated protein
expression

Epidermal cells:Not detected
 
 
 
 

Antibody staining

Antibody HPA053977

 

Antibody HPA058943

 

Epidermal cells

Not detected   Not detected  
      
      
      
   
   
   

SKIN - HPA RNA-seq

Average TPM

0.0

overview Female, age 34
Sample 1
TPM: 0.0
Cell types%
Keratinocytes: 60
Other cell types: 40
overview Female, age 30
Sample 2
TPM: 0.0
Cell types%
Keratinocytes: 55
Other cell types: 45
N/A Male, age 57
Sample 3
TPM: 0.0

SKIN - GTEx RNA-seq

Average RPKM

40.5

GTEx sample id

RPKM

 

Skin - Not Sun Exposed (Suprapubic)

Skin - Not Sun Exposed (Suprapubic)
RPKM: 62.3
Samples: 250

Max RPKM: 1433.4
Min RPKM: 0
Std RPKM: 190.7
Median RPKM: 0
GTEX-WFON-1926-SM-3LK7L 1433.4
GTEX-145MG-1526-SM-5Q5EM 1141.3
GTEX-WH7G-2026-SM-3NMBL 1038.0
GTEX-WYJK-0526-SM-3NM8Z 858.8
GTEX-13NZ9-2626-SM-5L3FK 809.1
GTEX-12WSC-2826-SM-5BC5Y 736.8
GTEX-11O72-0626-SM-5PNYE 696.9
GTEX-ZYFD-0626-SM-5E44E 666.5
GTEX-XK95-0226-SM-4AT58 608.7
GTEX-145MO-2826-SM-5LU96 551.7
GTEX-145MF-0926-SM-5Q5EA 547.6
GTEX-WK11-2726-SM-3NMAQ 497.9
GTEX-11DXW-0826-SM-5H118 480.9
GTEX-12KS4-2126-SM-5FQUT 460.4
GTEX-ZZ64-1026-SM-5GZXG 408.7
GTEX-11WQK-1026-SM-5EQLX 378.0
GTEX-139TT-2126-SM-5LZWC 365.6
GTEX-ZVE1-0726-SM-51MRN 308.9
GTEX-1211K-1526-SM-5FQU4 298.3
GTEX-ZT9W-1126-SM-57WDR 253.2
GTEX-13OVL-0126-SM-5L3GJ 231.7
GTEX-13N11-2326-SM-5IJBF 224.3
GTEX-145LT-0526-SM-5LUB2 203.4
GTEX-139TU-0726-SM-5L3EK 191.3
GTEX-13G51-1826-SM-5KLZH 185.4
GTEX-13X6K-0626-SM-5LU5D 175.2
GTEX-12C56-1526-SM-5FQUQ 149.1
GTEX-13D11-0926-SM-5J2NC 140.7
GTEX-YJ8O-2526-SM-5HL85 136.3
GTEX-Z93S-1626-SM-5CVMB 125.2
GTEX-UPJH-0226-SM-3GADV 119.2
GTEX-ZAJG-1526-SM-5CVML 117.6
GTEX-X3Y1-2026-SM-3P5YM 104.4
GTEX-ZVTK-0226-SM-51MRG 98.7
GTEX-XQ3S-1426-SM-4BOPR 86.9
GTEX-WRHU-2826-SM-3MJG8 85.3
GTEX-ZYW4-0626-SM-59HJR 67.0
GTEX-YEC4-1826-SM-4W1YP 58.1
GTEX-WYVS-1626-SM-3NM9R 48.9
GTEX-12ZZX-2426-SM-5GCOE 36.0
GTEX-11DXX-2126-SM-5PNYR 32.9
GTEX-12584-0726-SM-5FQTK 32.8
GTEX-11NUK-2726-SM-5A5MC 31.7
GTEX-ZPCL-1126-SM-4WWFE 28.8
GTEX-XPVG-2126-SM-4B667 27.3
GTEX-13IVO-0726-SM-5LZYV 26.5
GTEX-146FQ-2126-SM-5RQHU 26.0
GTEX-14BMU-1226-SM-5S2OR 25.4
GTEX-11DYG-1526-SM-5A5JS 22.8
GTEX-WEY5-2326-SM-3GIKK 21.1
GTEX-11EQ9-1626-SM-5PNY8 20.7
GTEX-WHSE-0126-SM-3NMBT 15.8
GTEX-11EI6-2826-SM-5H11D 14.9
GTEX-WHWD-1826-SM-3LK6I 13.3
GTEX-131XG-0326-SM-5L3DX 12.3
GTEX-XMD2-2126-SM-4YCF8 10.8
GTEX-11NSD-0626-SM-5A5LU 9.8
GTEX-13X6J-0626-SM-5LU5F 9.1
GTEX-13U4I-2226-SM-5LU5H 8.4
GTEX-ZYFG-1526-SM-5GZYM 7.6
GTEX-147F3-1726-SM-5SIAW 6.8
GTEX-12WSM-1926-SM-5BC65 6.6
GTEX-14A5H-0826-SM-5QGPJ 6.4
GTEX-14BIN-1126-SM-5RQJZ 6.3
GTEX-Y5V5-0126-SM-5S2NW 6.0
GTEX-13NZ8-1226-SM-5KM4A 5.7
GTEX-WI4N-2726-SM-3LK7Y 4.1
GTEX-XAJ8-1426-SM-47JYM 4.1
GTEX-ZT9X-1526-SM-5DUXD 2.5
GTEX-13112-0126-SM-5P9IU 2.4
GTEX-13PL6-1126-SM-5L3IE 2.3
GTEX-13NYS-0626-SM-5L3F1 1.9
GTEX-WHPG-2626-SM-3NMBR 1.7
GTEX-Y5V6-2326-SM-4VDSA 1.4
GTEX-ZAK1-0626-SM-5HL8E 1.3
GTEX-Y8LW-1526-SM-5IFHL 1.2
GTEX-11TUW-0626-SM-5LU9M 1.1
GTEX-X4EO-2926-SM-4E3JH 1.1
GTEX-139D8-1126-SM-5LU8W 0.9
GTEX-13OW8-1026-SM-5J1NQ 0.9
GTEX-11TT1-1826-SM-5EQLV 0.8
GTEX-131XH-0126-SM-5LZUY 0.7
GTEX-13N2G-0226-SM-5K7VF 0.2
GTEX-13NYC-0126-SM-5L3F4 0.2
GTEX-13VXU-0626-SM-5L3F9 0.2
GTEX-ZWKS-0626-SM-5GIDV 0.2
GTEX-111YS-1526-SM-5GZYW 0.1
GTEX-11DXZ-2026-SM-5987S 0.1
GTEX-12696-0126-SM-5EQ4L 0.1
GTEX-12WSA-0426-SM-5EQ5X 0.1
GTEX-12WSH-1526-SM-5BC5W 0.1
GTEX-131YS-2826-SM-5EQ47 0.1
GTEX-13N1W-2426-SM-5IJD1 0.1
GTEX-144GO-2026-SM-5O99P 0.1
GTEX-ZU9S-1826-SM-5NQ9E 0.1
GTEX-ZYFC-0426-SM-5GICQ 0.1
GTEX-ZYT6-2326-SM-5GZY3 0.1
GTEX-1117F-2926-SM-5GZYI 0.0
GTEX-111CU-1126-SM-5EGIM 0.0
GTEX-111VG-1626-SM-5EGIO 0.0
GTEX-117YX-1926-SM-5GIEC 0.0
GTEX-1192X-2726-SM-5N9DN 0.0
GTEX-11DXY-0126-SM-5H11Q 0.0
GTEX-11DZ1-2426-SM-5GZZX 0.0
GTEX-11EM3-1226-SM-5N9DD 0.0
GTEX-11EQ8-0926-SM-5H12V 0.0
GTEX-11GS4-0226-SM-5HL77 0.0
GTEX-11GSP-2326-SM-5HL63 0.0
GTEX-11LCK-2226-SM-5HL4Q 0.0
GTEX-11OF3-0126-SM-5PNYF 0.0
GTEX-11P7K-1126-SM-5HL4L 0.0
GTEX-11P81-2226-SM-5PNYI 0.0
GTEX-11P82-1426-SM-5BC5L 0.0
GTEX-11PRG-0726-SM-5EGL1 0.0
GTEX-11UD2-2526-SM-5CVNU 0.0
GTEX-11VI4-1126-SM-5EQMD 0.0
GTEX-11WQC-1826-SM-5GU59 0.0
GTEX-11ZTT-2126-SM-5CVLO 0.0
GTEX-11ZU8-0126-SM-5EQ58 0.0
GTEX-11ZUS-2626-SM-5FQUR 0.0
GTEX-12126-0826-SM-5FQTZ 0.0
GTEX-1212Z-0126-SM-59HK4 0.0
GTEX-1269C-0126-SM-5EQ5L 0.0
GTEX-12BJ1-0926-SM-5EQ62 0.0
GTEX-12WSB-2926-SM-59HKL 0.0
GTEX-12WSD-0626-SM-5GCMW 0.0
GTEX-12WSJ-1126-SM-5LZVJ 0.0
GTEX-12WSK-2126-SM-5CVNC 0.0
GTEX-12WSL-2026-SM-5GCML 0.0
GTEX-12ZZY-0726-SM-5EQ66 0.0
GTEX-12ZZZ-0726-SM-5GCNZ 0.0
GTEX-13113-1626-SM-5EQ4I 0.0
GTEX-1313W-0626-SM-5EQ4H 0.0
GTEX-1314G-1326-SM-5BC6E 0.0
GTEX-131XE-1626-SM-5K7VO 0.0
GTEX-131XF-2626-SM-5EQ6K 0.0
GTEX-131XW-0626-SM-5PNVD 0.0
GTEX-132AR-0326-SM-5KM2C 0.0
GTEX-133LE-2326-SM-5K7W3 0.0
GTEX-1399Q-2326-SM-5KM2X 0.0
GTEX-1399S-0126-SM-5IJCF 0.0
GTEX-1399U-1126-SM-5L3DB 0.0
GTEX-139T8-0626-SM-5KLZX 0.0
GTEX-139TS-2126-SM-5K7XC 0.0
GTEX-139UW-0326-SM-5J1ML 0.0
GTEX-139YR-1026-SM-5LZYN 0.0
GTEX-13FH7-1126-SM-5K7UG 0.0
GTEX-13FHO-0426-SM-5L3F5 0.0
GTEX-13FLV-0126-SM-5K7WT 0.0
GTEX-13FTW-0326-SM-5K7UW 0.0
GTEX-13FTX-1526-SM-5K7VJ 0.0
GTEX-13FTY-2126-SM-5IFFB 0.0
GTEX-13JUV-2026-SM-5K7UA 0.0
GTEX-13JVG-0726-SM-5KM16 0.0
GTEX-13NYB-0126-SM-5J1MD 0.0
GTEX-13O3O-2326-SM-5IJD6 0.0
GTEX-13O3Q-0126-SM-5KM34 0.0
GTEX-13O61-1426-SM-5KM3D 0.0
GTEX-13OVG-1626-SM-5J1NF 0.0
GTEX-13OVH-0526-SM-5L3E6 0.0
GTEX-13OVJ-0826-SM-5J1OK 0.0
GTEX-13OW5-2326-SM-5L3HO 0.0
GTEX-13OW6-2726-SM-5J2OE 0.0
GTEX-13OW7-0426-SM-5K7VK 0.0
GTEX-13PDP-0726-SM-5L3HP 0.0
GTEX-13PVQ-0626-SM-5LU47 0.0
GTEX-13PVR-0426-SM-5RQK2 0.0
GTEX-13QBU-1226-SM-5LU4G 0.0
GTEX-13RTJ-0126-SM-5S2NN 0.0
GTEX-13SLW-0626-SM-5Q5ER 0.0
GTEX-13VXT-1926-SM-5K7UO 0.0
GTEX-13W3W-0726-SM-5IJDQ 0.0
GTEX-13X6H-0926-SM-5SIB2 0.0
GTEX-13X6I-1826-SM-5SIAO 0.0
GTEX-144FL-0626-SM-5LU43 0.0
GTEX-144GL-0626-SM-5LU4D 0.0
GTEX-145ME-1726-SM-5Q5EU 0.0
GTEX-145MH-2826-SM-5RQJF 0.0
GTEX-145MI-0626-SM-5SI8S 0.0
GTEX-145MN-1526-SM-5SI9T 0.0
GTEX-14753-0726-SM-5QGQO 0.0
GTEX-147JS-0226-SM-5S2U9 0.0
GTEX-148VJ-0626-SM-5LUAW 0.0
GTEX-1497J-0226-SM-5QGPU 0.0
GTEX-14A6H-2026-SM-5Q5DD 0.0
GTEX-14AS3-1526-SM-5Q5ED 0.0
GTEX-14B4R-1326-SM-5Q5EZ 0.0
GTEX-14C38-0726-SM-5SI6M 0.0
GTEX-14C39-1726-SM-5RQIL 0.0
GTEX-14E6C-2426-SM-5S2NF 0.0
GTEX-U8XE-0226-SM-4E3J3 0.0
GTEX-V1D1-2026-SM-3GAF4 0.0
GTEX-VUSG-2326-SM-4KL1U 0.0
GTEX-W5X1-2526-SM-3GILC 0.0
GTEX-WFG7-2026-SM-5SI7P 0.0
GTEX-WHSB-1326-SM-3LK6W 0.0
GTEX-WXYG-2026-SM-4E3IY 0.0
GTEX-WY7C-2126-SM-3NB2R 0.0
GTEX-WYBS-0626-SM-3NMAS 0.0
GTEX-X4EP-0626-SM-3P621 0.0
GTEX-X585-2426-SM-46MW2 0.0
GTEX-X5EB-1926-SM-4E3IW 0.0
GTEX-X8HC-0626-SM-4E3HQ 0.0
GTEX-XBEC-0726-SM-4QARZ 0.0
GTEX-XBED-1926-SM-47JYP 0.0
GTEX-XBEW-1126-SM-4QARW 0.0
GTEX-XOT4-0626-SM-4B66L 0.0
GTEX-XOTO-0726-SM-4B659 0.0
GTEX-XQ8I-0926-SM-4BOOF 0.0
GTEX-XUJ4-1826-SM-4BOOU 0.0
GTEX-XUW1-0926-SM-4BONX 0.0
GTEX-XV7Q-1826-SM-4BRUV 0.0
GTEX-XXEK-1626-SM-4BRUZ 0.0
GTEX-XYKS-1426-SM-4BRUO 0.0
GTEX-Y111-0626-SM-4SOIT 0.0
GTEX-Y114-2126-SM-4TT8B 0.0
GTEX-Y3I4-1726-SM-4TT89 0.0
GTEX-Y3IK-1626-SM-4YCF5 0.0
GTEX-Y8E4-2026-SM-5IFJB 0.0
GTEX-Y9LG-1126-SM-4VBQ7 0.0
GTEX-YB5K-2026-SM-4VDT3 0.0
GTEX-YEC3-1326-SM-5PNXV 0.0
GTEX-YECK-0326-SM-4W1YS 0.0
GTEX-YFCO-1226-SM-5LUAT 0.0
GTEX-ZA64-1026-SM-5HL8R 0.0
GTEX-ZAB4-2126-SM-5HL8U 0.0
GTEX-ZC5H-1526-SM-5HL9Y 0.0
GTEX-ZDXO-3126-SM-5IJDF 0.0
GTEX-ZE7O-2726-SM-51MT5 0.0
GTEX-ZE9C-2526-SM-5IJDR 0.0
GTEX-ZF2S-1626-SM-57WES 0.0
GTEX-ZLFU-1826-SM-4WWBV 0.0
GTEX-ZLV1-1526-SM-4WWBC 0.0
GTEX-ZLWG-0826-SM-59888 0.0
GTEX-ZP4G-1426-SM-4WWCL 0.0
GTEX-ZPU1-1126-SM-4YCF3 0.0
GTEX-ZTSS-1426-SM-5985P 0.0
GTEX-ZTTD-2826-SM-4YCFA 0.0
GTEX-ZTX8-1326-SM-4YCEL 0.0
GTEX-ZVE2-2826-SM-5GU51 0.0
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GTEX-ZVT2-0126-SM-5GIDQ 0.0
GTEX-ZVT4-2426-SM-5GIEI 0.0
GTEX-ZVZP-1226-SM-5GID7 0.0
GTEX-ZXG5-2126-SM-59HKD 0.0
GTEX-ZY6K-1426-SM-5GZX2 0.0
GTEX-ZYVF-0926-SM-5E44J 0.0
GTEX-ZYWO-2226-SM-5GZXR 0.0
GTEX-ZYY3-2926-SM-5GIEB 0.0
GTEX-ZZPU-0826-SM-5GZX5 0.0
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Skin - Sun Exposed (Lower leg)

Skin - Sun Exposed (Lower leg)
RPKM: 25.2
Samples: 357

Max RPKM: 1180
Min RPKM: 0
Std RPKM: 90.7
Median RPKM: 0
GTEX-ZQUD-1426-SM-57WER 1180.0
GTEX-147F3-0526-SM-5SI98 514.2
GTEX-146FR-1326-SM-5SIAJ 498.0
GTEX-111CU-1926-SM-5GZYZ 381.3
GTEX-12126-0326-SM-5PNW3 337.1
GTEX-12ZZZ-0626-SM-5DUXI 323.8
GTEX-XOTO-0126-SM-4B66N 318.6
GTEX-Y5V6-2426-SM-4VDSB 278.8
GTEX-WZTO-0126-SM-3NM95 277.6
GTEX-OIZG-0726-SM-33HBL 254.3
GTEX-QCQG-1726-SM-3GIJ9 236.4
GTEX-U3ZH-2026-SM-3DB78 232.5
GTEX-Y111-0126-SM-4SOIV 226.7
GTEX-13OVL-0226-SM-5L3E9 199.5
GTEX-13PVQ-0126-SM-5SIB4 196.8
GTEX-11EMC-2926-SM-5EQ4F 187.3
GTEX-146FH-0126-SM-5QGPP 177.0
GTEX-13O21-1426-SM-5K7XI 167.3
GTEX-117YW-2626-SM-5GZZH 156.3
GTEX-QLQW-1126-SM-2S1Q8 153.8
GTEX-QEG5-0226-SM-2I5GI 140.0
GTEX-PWCY-1826-SM-5SI7U 136.4
GTEX-T8EM-1026-SM-3DB7M 119.8
GTEX-1399T-2826-SM-5KLYZ 119.4
GTEX-11TT1-2526-SM-5EGIB 108.7
GTEX-13O3Q-2426-SM-5IJBR 103.6
GTEX-11P81-2326-SM-59875 100.1
GTEX-13NYS-0126-SM-5MR3W 98.5
GTEX-Y8DK-0126-SM-4TT3L 92.1
GTEX-145ME-1826-SM-5SI9G 84.7
GTEX-Q2AG-0126-SM-33HBV 83.2
GTEX-12WSA-0226-SM-5BC5V 77.8
GTEX-13NYC-0326-SM-5K7WP 76.8
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